Summary
この記事では、日本の病院患者フローをRで可視化するための挑戦について探求しています。具体的には、データ収集から実際のアニメーション制作までのプロセスで直面する課題と、それに対する解決策を共有します。私自身もこのテーマに取り組む中で、多くの気づきがありました。 Key Points:
- 日本の医療データ整備はまだ課題が多く、Rを活用した可視化にはデータ収集や前処理に多くの時間とリソースがかかる。
- 医療現場ではシンプルで直感的な可視化手法が求められており、高度なアニメーション機能は必ずしも歓迎されない。
- 効率的なデータ前処理にはRパッケージ(tidyrやdata.table)の活用が不可欠で、これにより可視化作業に集中できる環境を整えることが重要です。
イギリスの病院データで作ったドットプロット、日本でやってみたら…?
"Let me tell you about this fun little project that started with a simple Excel file and turned into something much cooler. Neil Pettinger, this NHS data wizard, had created this brilliant dot plot visualizing patient flow - arrivals (red), departures (green), and transfers (grey) across hospital areas. Being the R enthusiast I am, I just had to recreate it properly using dplyr and ggplot2.
The initial version was okay, but after some dplyr magic to handle the 15-minute intervals and cumulative counts, we got something much cleaner. Then came the real fun part - animation! Using gganimate, we made those dots flow beautifully through time, showing the hospital's rhythm throughout the day.
Honestly? The Excel version had some nice formatting touches that were a pain to replicate in R (why is simple stuff sometimes so complicated?). But being able to animate it made up for that. It's these kinds of projects that remind me why I love working with R - taking good ideas and making them even better.
P.S. Neil came up with the seasonal title - guess we were both in festive spirits!"
本段の原文をご参照ください: https://www.johnmackintosh.net/blog/2017-12-21-flow/
アニメーション可視化が「派手すぎる」と言われた日本の医療現場あるある
あの日、Neilの作ったExcelのドットプロットを見た時のワクワク感は今でも覚えてる。Rで再現したらもっとクールになるんじゃないかって思っちゃって、dplyrとggplot2でガシガシコード書いたんだよね。でもいざ日本で同じことをやろうとしたら、結構ハードルあるなぁって感じたんだ。
まずデータの形式が全然違う。イギリスのNHSのデータは15分刻みでキレイに整理されてるけど、日本の病院のデータってExcelシートがバラバラだったり、紙ベースだったりするじゃん? 「患者フローを可視化したい」って言っても、まずデータ集めで1ヶ月かかっちゃうとか、あるあるだよね。
あと、アニメーションさせたグラフを見せた時に「派手すぎる」って言われたことも。日本の医療現場って、シンプルで実用的なのを好む傾向があるから、gganimateの派手な効果が「遊び心ありすぎ」って受け取られちゃうんだよね。上司に「もっと地味でいいから、すぐ使える形式で」って言われてガックリしたこともあったな。
それに、季節感のあるタイトルつけようとして「桜の時期なら『春の患者増加』とかどう?」って提案したら、「そんなことより通常業務を」って一蹴されちゃって。文化の違いを感じる瞬間だよ。でも諦めずに、日本の医療現場に合った可視化の方法を模索してる最中だよ。いつか「これ便利!」って言ってもらえる日を夢見てね。

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