Rで可視化する日本の病院患者フロー:データ収集からアニメーションまでの挑戦


Summary

この記事では、日本の病院患者フローをRで可視化するための挑戦について探求しています。具体的には、データ収集から実際のアニメーション制作までのプロセスで直面する課題と、それに対する解決策を共有します。私自身もこのテーマに取り組む中で、多くの気づきがありました。 Key Points:

  • 日本の医療データ整備はまだ課題が多く、Rを活用した可視化にはデータ収集や前処理に多くの時間とリソースがかかる。
  • 医療現場ではシンプルで直感的な可視化手法が求められており、高度なアニメーション機能は必ずしも歓迎されない。
  • 効率的なデータ前処理にはRパッケージ(tidyrやdata.table)の活用が不可欠で、これにより可視化作業に集中できる環境を整えることが重要です。
本記事では、日本の医療現場における可視化ツール導入時の課題とその解決策について深掘りし、実践的な洞察を提供しました。

スコットランドでAphAメンバーの一人が、患者フローをExcelじゃなくRで可視化してみた話。ネイルという情報系コンサルの方から、架空病院の動線データ(入院・退院や転棟)が載ったファイルを受け取って、色付きドットプロット作成に挑戦。最初は手間かかったが、dplyrやlubridate使えばSQLっぽく集計しやすいと気づいたらしい。赤は入院、緑は退院、グレーは転棟で、それぞれA&E・評価エリア・病棟ごとに分けて表現。15分単位でまとめてスタックする感じだったかな。Excelよりggplot2なら重なりもjitterで多少解消できる。ただラベル背景色とかタイトル色分け再現は結構面倒だとか。アニメーション化も試したらしいが、その辺の仕組みまで細かく説明しきれてない部分もあったような…。全体的には七十回くらいコード試行錯誤した雰囲気が伝わる内容だった印象。

本段の原文をご参照ください: https://www.johnmackintosh.net/blog/2017-12-21-flow/

日本の医療データ可視化の世界では、RやPythonのような高度なツールの導入は、まだまだ課題が多いでしょう。病院のITインフラや、データ分析に対する保守的な姿勢が大きな壁になりそうです。特に、電子カルテシステムとの互換性や、個人情報保護の厳格な規制が、新しい分析手法の導入を難しくしています。また、医療従事者のデータサイエンスリテラシーも、まだ十分に高くないため、こうした革新的なアプローチを理解し、受け入れてもらうのは容易ではないでしょう。

アニメーション可視化が「派手すぎる」と言われた日本の医療現場あるある

Reference Articles

アグリノートにオープンデータが追加されたキッカケ

・絞込み:新型コロナ検索モード時は病院の受診体制、通常検索モード時は診療. 科目. で絞込みが可能です。 ・データ保存:病院データを保存し、後から参照 ...

Source: デジタル庁

第7回中高生情報学研究コンテスト - ポスターへのコメント

会話を可視化することをデータをもとに可視化しようとする課題意識、ユーザに対してメタ認知をできる機能を実装している点が素晴らしいです。体験ユーザの調査件数を ...


johnmackintosh

Expert

Related Discussions

❖ Related Articles